单个样本(Single-Sample Data)的变异检测标准流程如下: 分析流程基本类似,以我前面组装的三代植物基因组为例跑一下这两个流程,强调一下我用的是植物基因组,后续无法用Germline的注释数据资源对变异集进行功能注释!因此这里只跑到变异集过滤的步骤,拿到SNP和INDEL。
摘要 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是基因组中最常见的遗传变异形式,在动植物基因组中的分布频率较高。通过对SNP分子标记的检测,可以筛选具有优良基因的后代,也可以鉴定动植...展开更多 Single nucleotide polymorphism(SNP)is the most common form of genetic variation in the genome and is ...