新冠病毒变异株JN.1近期在多国迅速传播,目前我国本地已监测到7例JN.1变异株,该消息在社交媒体上备受关注。 虽然现在JN.1变异株在我国流行水平较低,但后续可能受国际流行和境外输入病例影响,不排除J… 阅读全文 赞同 添加评论 分享 ...
全基因组核苷酸序列同源性比较 析 利用 DNAStar 6.0,MEGA.4.0 分析 3 株 PCV2 贵 州流行株与国内外流行株基因序列系统进化关系, 结果见图 6.3 株 PCV2 贵州流行株之间亲缘关系近, 位于一个大的分支上.3 株贵州 PCV2 流行毒株与多 数国内流行毒株在 PCV2d 的大分支上,且与国产疫 苗毒株 SH 株进化关系...
测序结果运用DNA Star进行分析,并在NCBI网站上进行BLAST比对,确定近缘株细菌的种属。 [0068]结果显示:菌株SF259的gyrA基因与Bacillus velezensis模式菌gyrA基因序列的相似度达99%,而与Bacillus amyloliquefaciens模式菌gyrA基因序列的相似度仅为96%。使用MEGA6.0构建持假基因的系统发育树,结果见图3。 [0069]实施例4 贝...
一株新型鹅星状病毒鉴定及遗传演化分析
PEDV变异株的分离鉴定和S1基因序列分析
利用DNA Star软件中的MegAlign工具将未明确分型HAdV序列与已知序列进行比对,分析基因序列之间的同源性,算法选择Clustal W[10]。 2 结果 2.1 HAdV基因组的系统进化分析 系统进化树结果显示:同亚属的HAdV之间进化关系十分明显,可以用来推测未明确分型病毒...
我国从不同地区的SCN的孢囊上分离到生防真菌共30个属51种,其中以厚垣轮枝菌(V.chlamydosporium)、尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)、淡紫拟青霉菌(P.lilacinus)等出现频率最高(李进荣,段玉玺,陈立杰,薛春生.大豆根瘤内生细菌对大豆胞囊线虫影响研究[J].大豆科学,2005,24(2):154-156;林茂松.真菌寄生大豆孢囊线...
对我国用于生产的3种猪支原体肺炎活疫苗菌株(168株,RM48株,Z株)进行P46和P97R1R2基因序列分析,考察其保守性和差异.提取来源于四家猪支原体肺炎活疫苗生产企业的疫苗株基因组DNA,以其为模板进行PCR扩增,测序;利用DNAStar序列分析软件对测序结果和国际标准株J株,232株,7448株,7422株一起进行比对,分析3种疫苗菌株和...
1.6 病毒F基因片段的序列分析测序后以基因分析软件DNAStar和MEGA5分析测序结果,将这7株所测定的分离株的F基因序列与其他在GenBank上已有的部分NDV代表株的F基因片段作序列比较,分析F基因的同源性,并根据F基因47~420位核苷酸绘制系统发育进化树。 2、结果 ...
根据表2显示的百分比序列同一性与系统树图,致病性野生型病毒分离株的基因差异非常明显,且代表多个组的PRRSV分离株。相反地,亲代与疫苗PRRSV对在基因上相同。表2的成对比较(pairwise comparison)与系统树图是用序列分析工具中的Lasergene软件套件(DNASTAR,Inc.,Madison,WI)所产生。