扩增子是指在PCR反应中扩增出来的特定DNA片段,通常用于研究特定基因或基因组区域的变异情况。扩增子测序原理主要包括样品准备、PCR扩增、文库构建、高通量测序和数据分析等步骤。 首先,样品准备是扩增子测序的第一步。研究者需要从样品中提取DNA,并根据研究需要设计合适的引物进行PCR扩增。引物的选择至关重要,它决定了...
4.文库构建:将PCR扩增产物纯化、定量后,进行文库构建。可以使用商业试剂盒进行文库构建。 5. 测序:采用高通量测序平台(如Illumina MiSeq)对文库进行测序。常采用双端测序,可同时测序16S rRNA的两个可变区域。测序结果通常以FASTQ格式存储。 6.数据预处理:对测序数据进行初步处理,包括去除低质量序列、去除引物序列、去...
图1. 标准扩增子建库流程。 标准扩增子建库流程为在完整模板的基础上投入多重扩增的Panel进行多重扩增,随后将得到的扩增子进行引物消化,消化掉多余的引物二聚体以及两端引物本身的部分序列,获得平末端的结构,与接头连接后形成完整文库。 2、两步法扩增子建库流程 图2. 两步法扩增子建库流程。 两轮扩增的方法原理是...
一种ctdna精准测序的扩增子文库构建方法,包括以下步骤: s01:cfdna随机连接再随机片段化并加接头建库; s02:cfdna非靶向/靶向文库扩增。 进一步的,所述步骤s01具体为:抽提纯化cfdna之后,对cfdna进行质量检测,取经质检合格的cfdna10-30ng,采用连接酶连接3-5小时,然后采用磁珠对cfdna进行纯化,溶解于8-12μlddh2o,纯化...
1.一种扩增子测序文库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:获得样本DNA;利用第一引物、第二引物和第三引物对所述样本DNA进行第一PCR扩增,得到扩增产物;利用第四引物和第五引物对所述扩增产物进行第二PCR扩增,得到扩增子测序文库;其中,所述第一引物从5’端到3’端依次为第一测序标签序列和扩增子特异性正向引物;...
【专利摘要】本发明公开了一种适用于扩增子测序文库构建的引物及扩增子测序文库的构建方法。该引物由一条上游引物和一条下游引物构成,且上游引物和下游引物按照从5’端至3’端的顺序均包括接头序列、测序引物序列和目的片段扩增引物序列。本发明所提供的引物,通过将接头序列、测序引物序列和目的片段扩增引物序列整合在于...
(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002代理人商秀玲(51)Int.Cl.C40B50/06(2006.01)C12N15/11(2006.01)C12Q1/6869(2018.01)审查员纪圆圆(54)发明名称一种适用于单端测序的扩增子文库构建引物组和构建方法(57)摘要本发明涉及高通量测序技术领域,具体涉及一种适用于单端测序的扩增子文库构建引物组和构建...
本发明公开了基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,所述引物组合通过改变引物3’端碱基序列或引入硫代磷酸酯键修饰得到。本发明所公开的基于人基因组扩增子的illumina测序文库构建的引物组合,能降低非目标条带的扩增。 (19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号CN117701691A (43)申请公布...
扩增子测序文库及其构建方法专利信息由爱企查专利频道提供,扩增子测序文库及其构建方法说明:扩增子测序文库及其构建方法,本发明提出测序接头,所述测序接头包括依次相连的基底结合序列、测序引...专利查询请上爱企查
ITS测序：在真核生物中，18S rDNA和28S rDNA转录间隔序列称为ITS区。ITS由于是非转录区，承受的选择压力较小，变异强。ITS属于中度保守区域，利用它可研究种及种以下的分类阶元。扩增子测序研究对象。扩增子测序技术优势：鉴定效率高：与克隆或培养等传统鉴定方法相比，微生物群16S/18S/ITS测序是一种更快、更准确...