一步扩 增文库上机测序时,只能和相同可变区的扩增子文库混为一个运行通道(run),这样不仅影 响排机测序灵活性,而且无法保证测序质量。[0013] Truseq PCR-free建库法可以直接使用Illumina Miseq相配套的试剂进行测 序,且样本间生物学聚类合理,同一样本的重复性好,但是试剂成本较高(TruSeq DNA PCR-Free Sample ...
[0013] 进一步地,引物为16SV4、18SV4或ITS1多样本扩增子文库构建的引物;当引物 为16SV4多样本扩增子文库构建的引物时,引物包括:16SV4正向序列:SEQIDNO:l、SEQ IDNO:2、SEQIDNO:3、SEQIDNO:4和SEQIDNO:5 ;16SV4反向序列:SEQIDNO:6、SEQ IDNO:7、SEQIDNO:8、SEQIDNO:9 和SEQIDNO: 10 ;当引物为...
本发明提供了一种扩增子文库及其构建方法。该构建方法包括以下步骤:S1,对多样本的目的片段进行PCR扩增,得到多个扩增产物;S2,对多个扩增产物进行等量混合,得到混合产物;S3,对混合产物依次进行片段化、末端修复和3’末端加“A”,得到带“A”修复产物;S4,采用PCR-free的接头对带“A”修复产物进行接头连接,得到扩增子文...
一、16S全长扩增子的原理 16S rRNA是细菌和古细菌的小亚基核糖体RNA,在细菌和古细菌中高度保守。通过对16S rRNA基因的扩增和测序,可以获得微生物群落中不同物种的16S rRNA序列信息。为了获得16S全长扩增子,需要设计引物覆盖整个16S rRNA基因,并进行PCR扩增。扩增子的测序结果可以通过比对数据库中的16S rRNA序列,确定...
本发明公开了一种快速构建扩增子文库的方法,包括以下步骤:1、合成用于构建DNA样品的扩增子文库的融合引物组合;2、构建DNA样品的PCR反应体系,将根据目标扩增子设计的上游融合引物和根据目标扩增子设计的下游融合引物混合以作为PCR反应体系中的引物组合;3、进行PCR。该方法可以简便、快速的经1步PCR构建扩增子文库,且由于...
通过这些方案，DNA提取，宏基因组文库制备或扩增子文库制备耗时大约分别为3小时、5小时和6小时。此外，扩增子和宏基因组文库制备的小型化将化学和塑料成本从4.9美元降低到3.6美元，从52.2美元降低到7.3美元。正文 测序成本的大幅降低使更多的研究人员在他们的研究领域特别是在微生物生态学领域利用下一代测序技术...
锋 初明明(51)Int.Cl.C12Q 1/6806 (2018.01)C40B 50/06 (2006.01) (54)发明名称基于扩增子的文库构建方法(57)摘要本公开内容涉及一种基于扩增子的文库构建方法,其特征在于包括以下步骤:1)提供DNA例如抽提的DNA;2)对所述DNA进行超声打断以形成打断后的DNA;和3)对所述打断后的DNA进行扩增以形成扩增子文库。
该构建方法包括以下步骤:S1,对目的片段进行扩增,得到富集目的片段;以及S2,对富集的目的片段进行片段化文库构建,得到扩增子文库;其中,步骤S1包括以下步骤:S11,对目的片段的扩增模板进行定量;S12,对目的片段的扩增引物的退火温度进行固定;以及S13,利用扩增引物在退火温度下对目的片段进行扩增,得到富集目的片段。上述构建...
相比于上一代产品(Vazyme #NA201),该试剂盒的建库测序质量有了极大提高,优化的多重扩增模块对不同起始量模板和定制化Panel均有着良好的扩增表现,升级的消化模块可有效解决PCR产物污染风险并提高数据的利用率,最新的连接模块提高了有效文库占比。全方面的产品升级提高了扩增子文库覆盖度和均一度,有效建库使结果更加稳...
1、标准扩增子建库流程 图1. 标准扩增子建库流程。 标准扩增子建库流程为在完整模板的基础上投入多重扩增的Panel进行多重扩增,随后将得到的扩增子进行引物消化,消化掉多余的引物二聚体以及两端引物本身的部分序列,获得平末端的结构,与...