在这篇文章中，作者们深入地探讨了单细胞谱系示踪技术的主要实现形式、重要应用及技术实现注意事项，并对该技术的进一步改进和应用进行了展望。1. 单细胞谱系示踪技术的实现形式 不同于传统的荧光遗传示踪技术，在单细胞谱系示踪技术中，承载遗传示踪信息的元件是一条或者一组DNA序列片段，简称为条形码。由于条形码的多样...
鉴定出56种胚胎细胞的发育轨迹;随后Anna-Katerina Hadjantonakis和Dana Pe’er实验室共同在单细胞转录组水平上解析了内胚层细胞的发育路径【3】;Chan等结合基因编辑技术进行谱系示踪,揭示了原肠
鉴定出56种胚胎细胞的发育轨迹;随后Anna-Katerina Hadjantonakis和Dana Pe’er实验室共同在单细胞转录组水平上解析了内胚层细胞的发育路径【3】;Chan等结合基因编辑技术进行谱系示踪,揭示了原肠
尽管在实验技术可操作性和后续数据分析上仍然存在一定的不确定性，但与当前时空转录组测序、谱系示踪等技术互补结合，如果未来应用于灵长类着床后胚胎发育研究上，将会在时空多维度上高精度地揭示胚胎发育过程中的基因表达谱和潜在的谱系命运调控机制。 原文链接： https://doi.org/10.1038/s41586-019-1469-8 来源...
本课题组的主要研究方向是利用单细胞测序、单细胞谱系示踪、生物信息学以及高通量、高精度原位空间多组学技术来揭示器官发育、疾病与组织再生中的细胞谱系,深入探究多能干细胞参与器官重建的功能与机制。课题组在包括Nature, Nature Methods, Nature Genetics,Developmental Cell,Cell Reports,Nature Protocols,National ...
彭广敦研究员,博士毕业于中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所,曾在加州大学洛杉矶分校从事计算生物学博士后研究,现为中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员,博士生导师。本课题组的主要研究方向是利用单细胞测序、单细胞谱系示踪、生物信息学以及高通量、高精度原位空间多组学技术来揭示在体多能干细胞在器官发育...
以往的研究通过抗体染色、细胞分选、类器官培养等体外方法研究BASCs的功能,而BASCs缺乏独特的分子marker,作为一种新的肺多能干细胞在体内肺损伤修复中承担什么角色一直存在争论,传统的谱系示踪技术并不支持BASCs的存在以及参与肺修复再生的功能。 2月18日,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组、季红斌研究组...
研究工作聚焦于多能干细胞的时空动态细胞谱系以及转化应用,建立了新型单细胞谱系示踪技术、自动化深度单细胞测序平台、基于激光显微切割的原位空间转录组技术,以及结合微流控芯片的新型空间多组学技术;系统的绘制了小鼠着床后胚胎三个胚层建立...
此外,结合时空转录组和单细胞转录组测序分析,作者们发现E7.0天胚胎近端和远端内胚层已经具有完全不同的转录组特征。与已报道谱系示踪研究结论吻合,时空特异性测序分析同样支持胚外来源细胞向胚胎内胚层状态的转变与融合。最后,整合测序分析线索与体外组织块培养等技术,作者们发现Hippo信号参与调控了早期内胚层的发育。