虽然IVW方法显示BFFM和FI之间有因果关系,但MR-Egger方法显示了相反的方向,表明因果关系是无效的。(图3)。 5、混杂因素分析 通过Phenoscanner对超重相关的SNPs、GWASes和疾病的相关信息进行总结和分析后,我们发现了一些潜在的混杂因素,主要包括物质/能量代谢、性激素、心血管疾病、糖尿病、认知功能障碍、吸烟、饮酒、肾...
同样地,这次回归得出来的beta,se和P值就是MR分析的结果。 其实我们不难看出,IVW和MR-Egger这两个的核心算法都是很简单的,两者最大的区别就是回归时是否考虑截距项的存在。 在IVW的假设中,我们认为这些SNP(也称IV)是没有多效性的,同时考虑到GWAS的结果多为表型标准化后做出来的,所以我们认为结局和暴露之间是...
其实我们不难看出,IVW和MR-Egger这两个的核心算法都是很简单的,两者最大的区别就是回归时是否考虑截距项的存在。 在IVW的假设中,我们认为这些SNP(也称IV)是没有多效性的,同时考虑到GWAS的结果多为表型标准化后做出来的,所以我们认为结局和暴露之间是正比例关系。因此,我们在使用IVW方法必须要保证这些SNP没有多...
MR-Egger 回归对这种强烈违反 IV1 的情况更为稳健,其估计值的偏差较小,且随着样本量的增加而减小。 同样,使用 MR-Egger 回归对因果零假设的拒绝率也只是略微夸大。 在方案(d)下,MR-Egger 检验检测多向效应的能力也显著提高,当 N = 1000 时,检测能力超过 70%。 MR-Egger弱化了传统孟德尔随机化方法对工具变...
这个代码和IVW的非常相似,区别就在于少了-1,这是因为R函数lm()里默认回归模型保留截距项。同样地,这次回归得出来的beta,se和P值就是MR分析的结果。 因此我们不难看出,IVW和MR-Egger这两个的核心算法都是很简单的,两者最大的区别就是回归时是否考虑截距项的存在。
↓ IVW 逆方差加权法 结果存在异质性,解释时应谨慎,截距不为0就存在异质性;存在多效性就不要再做这个课题了。 漏斗图:点在两边分布的频率应该差不多是对称的。 什么是敏感性分析? 敏感性分析就是通过一些手段鉴定结果是否靠谱的一项分析。如果敏感性分析发现结果不可靠,就需要用 Outlier detection, Multivariable...
# 1 Body mass index || id:ieu-a-2 MR Egger 79 # 2 Body mass index || id:ieu-a-2 Weighted median 79 # 3 Body mass index || id:ieu-a-2 Inverse variance weighted 79 # 4 Body mass index || id:ieu-a-2 Simple mode 79 ...
然而,在采用随机效应IVW模型的MR研究中,认为这种异质性水平是可接受的。重要的是,与IVW估计值相比,13种确定的致病蛋白在所有MR方法(MR-Egger,加权中位数,简单模式,加权模式)中表现出一致的方向估计值,这证实了作者的MR结果高度可靠。使用MR分析了1655种循环蛋白与MI的因果关系(图2 B)。有7种血浆蛋白与心肌...
反向 MR 分析的结果显示 BMI 与 LST 可能性的遗传预测之间存在正相关,而 BMI 和 MVPA 之间存在负相关(表 S7)。没有发现方向性多效性的证据,如无意义的 MR-Egger 截距所示。此外,未发现其他被检查的介质(包括 BF%、T2DM、FG、FI、TG、TC、HDL、LDL、PP)与 LST 或 MVPA 之间的关系。
在按十分位数进行更精细的分层中,在HDL-C的第1、第2和第3十分位数的MVMR-IVW和MVMR-Egger中都观察到与CVD和CHD的显著相关性;在第二个十分位数观察到与中风的显著相关性,而在FDR调整后,MVMR Egger的相关性并不显著。 设计与统计学方法一、研究设计 P(Population)参与者:UKB中符合条件的348,636名欧洲...