AI/ML技术展现出了为合成生物学提供所需预测能力的巨大潜力,可以应用于合成生物学过程的各个环节(如图1所示)。 这期特刊集中展示了AI/ML在合成生物学中的广泛应用,以及目前正在探索的各种最先进的AI/ML架构。让我们一起来看看这些激动人心的研究进...
与AI在合成生物领域的潜力相比，它在合成生物领域的影响有限。我们已经看到了AI的成功应用，但仍然局限于特定的数据集和研究问题。AI在该领域目前面对的挑战，仍然是对更广泛的应用程序和其他数据集来说有多大的通用性。数据挖掘、统计和机械建模目前是该领域计算生物学和生物信息学的主要驱动因素，但这些技术与人工智能...
最后,许多流行的AI算法解决方案没有明确地考虑不确定性,也没有显示出在输入扰动下控制误差的鲁棒机制。考虑到我们正在尝试设计的生物系统中固有的随机性和噪声,这种基本差距在合成生物空间中尤其重要。 指标/评估的挑战。基于预测和准确性的标...
合成生物产出的“牛奶”在医疗健康、化工、农业、食品等多个领域具有广泛的应用场景。麦肯锡咨询公司曾发布数据，预计到2025年，合成生物学与生物制造的经济影响将达到1000亿美元；2030～2040年，合成生物学每年带来的经济影响将达到1.8万亿～3.6万亿美元。随着人工智能（AI）技术的快速发展，越来越多的研究者开始探索...
它与人工智能（AI）的结合，正成为推动医药研发创新的重要力量（图1）。AI在生物合成中的应用，不仅加速了生物系统设计的精确性和预测性，还极大地提高了研发效率。通过机器学习，AI能够处理和分析大量复杂的生物数据，从而预测生物系统的行为和特性。这种预测能力对于设计具有特定功能的生物系统至关重要，例如，设计能够...
MjTyrRS改进方法一——AI预测: 我们选择MjTyrRS的tRNA结合区域作为酶改造的靶点,基于蛋白质大语言模型,利用AI算法进行高活性突变体的预测。蛋白质大模型ESM是一种无监督的蛋白质语言模型,其核心思想是将蛋白质序列看作一种语言,每个氨基酸看作一个字符,然后用一个自回归的神经网络来学习这种语言的统计规律。ESM模型是...
导语:作为2024年服贸会重要组成部分之一,国家卫生健康委员会百姓健康频道(CHTV)定于9月13日在京举办“2024首都国际医学大会的平行论坛——数智医疗与医学人工智能创新论坛”,CHTV&医学论坛网将为您带来AI赋能医疗的系列报道。在论坛举办前,本文先带大家了解一下AI与合成生物学是如何联手重塑药物研发的。
最后,许多流行的AI算法解决方案没有明确地考虑不确定性,也没有显示出在输入扰动下控制误差的鲁棒机制。考虑到我们正在尝试设计的生物系统中固有的随机性和噪声,这种基本差距在合成生物空间中尤其重要。 指标/评估的挑战。基于预测和准确性的标准AI评价指标不足以应用在合成生物学领域中。像ℝ这样的回归模型或基于分类...
AI和合成生物学在一些方面存在重叠,比如将现有AI/ML应用于现有数据集;生成新的数据集(例如即将到来的NIH Bridge2AI);并创造新的AI/ML技术来应用于新的或现有的数据。虽然SD2在最后一项中有所贡献,但其仍有一定潜力,未来也有较长的路要走。 人工智能可以帮助合成生物学克服一个大挑战,即预测生物工程方法对生物...
不差钱的Ginkgo,选择用“买买买”的方式来获得AI技术加持。 2022年10月,Ginkgo Bioworks 宣布收购老对手Zymergen ,就此敲定了合成生物学领域迄今为止最重磅的一笔收购交易。 图:Ginkgo Bioworks 细胞编程平台 Zymergen,曾号称打造合成生物学的“谷歌搜索”平台,也是一众投资者追捧的香饽饽。