funlabel = c("1-Yeas OS", '3-Year OS','5-YearOS'), maxscale = 100, fun.at = c('0.95','0.85','0.80','0.70','0.6','0.5','0.4','0.3','0.2','0.1')) plot((nom),xfrac=.3) (6)C-index计算: f<-coxph(Surv(Months,Status==1) ~ Age+Pathologic_stage+PgR, data = bre...
cindex=0.617,说明模型一般。 校准曲线 也是基于上面计算出的cindex。 groupci(x = bmtcrr$preds.tenf, ftime = bmtcrr$ftime, fstatus = bmtcrr$Status, g = 5, # 分成几组 u = 36, # 时间点 failcode = 1, xlab = "Predicted 3-year mortality", ylab = "Actual 3-year mortality" ) plot ...
这将指示该患者的生存率(3年或5年OS)。 接下来,我们再往前走一步,我们来计算一个C-index。R语言中C-Index的含义与ROC相似。它的范围是0-1,越接近1,这个Cox回归模型的预测值就越准确。一般来说,如果C指数等于0.7,则模型拥有非常好的预测价值。 在本例中,C-Index等于0.7787,Se(C-index)等于0.0573。上述所...
计算30,60,120,180,240,360,400月的发生PCM的C-index。 cindex(fgr,data = dt,cause = 1,eval.times = c(30,60,120,180,240,360,400) 3.5 交互式列线图 3.5.1 创建一个加权数据集 library(mstate) df.w <- crprep("etime", "event", data=dt, trans=c(1,2), cens=0, id="id", kee...
采用一致性指数(C-index)和时间依赖性ROC曲线下面积(time-dependent AUC)来评估模型判别能力,利用校准曲线(calibration curve)测量由列线图产生的概率与观测到的实际概率的一致性,决策曲线(decision curve analysis, DCA)评估列线图的临床效益,受试者操作特征(reciver operating characteristic, ROC)曲线评估列线图风险...
评价COX回归的预测效果 我们主要计算“ C-index ”即C-指数和绘制矫正曲线,来对Cox回归的预测效果进行评价。1. 计算C-指数2. 绘制校正曲线 这里对参数做一些说明:重新调整模型函数res.cox2 这里是加上了x=T, y=T,Every great company starts with a great name. = 365三个参数:构建校正曲线...
在评价预后模型的预测精度时,C-index是一个常用的指标,也被称为一致性指数。它用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实值之间的区分度。C-index在0.5-1之间,0.5表示完全不一致,1表示完全一致。通常,C-index在0.50-0.70被认为是准确度较低的,0.71-0.90之间为准确度中等,而高于0.90则...
其中一致性指数(C-index)为0.853,对结石复发具有较好的预测价值。1年未复发率预测模型的AUC为0.98,3年未复发率预测模型的AUC为0.96,5年未复发率预测模型的AUC为0.84,显示该模型具有良好的预测性能(图2)。符合度使用校正曲线表示,以Boo...
九、步骤九:计算C指数(C-Index)并按原文建议绘制校准曲线 绘制的校准曲线如图18-2所示。 图18-2 基于列线图和相应的Cox回归模型的校准曲线 OS表示Overall survival(总体生存率)。 结果表明,经过本文修正后的模型的C指数为0.7914,高于周支...
从哈尔滨医科大学肿瘤医院入组80例患者作为外部验证集。由单因素或多因素Cox回归分析筛选的变量构建列线图,并通过一致性指数(C-index)、校准图和ROC曲线进行评价。SEER数据库中单独接受化疗和放化疗的患者使用倾向评分匹配进行统计学配对,并对筛选的变量进行亚组分析。