图8则是X-ray + EM总的分辨率分布,由于X-ray数目远大于EM,因此这个主要反映的是X-ray的分辨率分布。可以看出,X-ray的分辨率比EM要好很多,极差的很少,较多落在2.0 Å左右。 图8 X-ray + EM总的分辨率分布 PART 3 冷冻电镜简谈 可见,尽管经历了Resolution Revolution,EM的分辨率 (总体来讲) 仍然无法与X-...
X-ray的技术问题十年前就已经基本解决了,剩下的就是生物狗们怎么长晶体。而现在的冷冻电镜就如十五年前的X-ray,搞技术的人都涌进了这个领域,冷冻电镜的潜力还没有被彻底挖掘,个人感觉还会再火一阵。 冷冻电镜目前的局限在于只能做比较大的蛋白复合物,一般至少要300KD以上才比较好做,否则蛋白太小,电镜下很容易...
1. X射线晶体衍射(X-ray crystallography)2. 冷冻电镜(cryo-EM)3. 核磁共振(NMR)如下图所示,这三...
部分图片需点开放大看。 X-ray: X-ray Crystallography, X-ray Diffraction, X-ray晶体衍射EM: cryo-EM, 3DEM, Electron Microscopy, (冷冻)电镜NMR: NMR Spectroscopy, 核磁共振(光谱)PART 1 数目图1 A、B、C,依…
针对生物大分子中的蛋白质的研究,主要的研究手段有:核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)、X射线晶体学(X-ray crystallography)和冷冻电子显微镜(cryo-electron microscope, cryo-EM)。核磁共振主要针对溶液中的、分子量很小(约20kDa)的...
针对生物大分子中的蛋白质的研究,主要的研究手段有:核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)、X射线晶体学(X-ray crystallography)和冷冻电子显微镜(cryo-electron microscope, cryo-EM)。核磁共振主要针对溶液中的、分子量很小(约20kDa)的样品类型,最近几年已使用不多。近年来,也出现了一些新技术,微晶电子衍射(Mic...
针对生物大分子中的蛋白质的研究,主要的研究手段有:核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)、X射线晶体学(X-ray crystallography)和冷冻电子显微镜(cryo-electron microscope, cryo-EM)。核磁共振主要针对溶液中的、分子量很小(约20kDa)的样品类型,最近几年已使用不多。近年来,也出现了一些新技术,微晶电子衍射(Mic...
而且虽然理论上来说X射线晶体衍射最全能,任何蛋白都能看,而冷冻电镜术只能看很大的蛋白复合物(转折点的出现)但是X-ray解结构,需要高质量的蛋白晶体,而大部分蛋白及其复合物 不!结!晶!或者结晶出来的 不!衍!射! 2013年以前,冷冻电镜术的“像素”不够,看不了小的东西,广大科研人员只好耐着性子、反反复复地搞...
总的来说,目前获取实验结构的3种主要方法,X-ray、NMR,以及冷冻电镜,X-ray晶体衍射仍占据绝对主流,冷冻电镜则趋势向好,3种方法各有优缺点,都不完美,有些情况某种方法可能更合适。 图5[4]总结了一些3种方法的优缺点及适用情况:X-ray是比较成熟的方法,得到的结构一般分辨率还行,但有些蛋白很难得到可用的晶体;NM...
在结构生物学领域,最富传统意义的结构解析方式是X射线晶体学(X-ray crystallography),其研究对象是内部质点具有规则排列性质的晶体。但此方法必须以具有高质量的大尺寸晶体作为前提。然而得到质量较好的晶体对于分子量巨大或者结构柔性的对象来说往往较为困难,尤其是针对膜蛋白这一目前科研人员很感兴趣的对象,其结晶难度...