组蛋白与DNA之间的结合依靠的是组蛋白带正电的碱性基团和DNA带负电的磷酸基团之间的静电作用，如果用稀酸处理染色质，磷酸基团质子化失去所带的电荷，复合物解离，如果用高盐溶液处理染色质，阳离子与磷酸基团结合取代了组蛋白，导致解离
这是因为染色质中的DNA和蛋白质在稀酸或高盐溶液中的溶解度不同，通过离心的方法可以分离DNA和蛋白质。原理是利用了DNA和蛋白质在稀酸或高盐溶液中的溶解度不同。或者另一种说法是 DNA盘绕于组蛋白上，要分离它们，首先要使DNA从组蛋白上解离。DNA主要通过氢键和离子作用盘绕组蛋白八聚体1.65圈。