不同来源的lncRNA有不同的功能,比如Antisense的lncRNA可能会影响其基因组位置上编码的mRNA发生可变剪切;这些lncRNA虽然整体保守性不如mRNA,但它们的核心区域和启动子等元件还是相对保守的,这使得lncRNA在快速适应环境的同时,能有效表达并找到自己的作用目标(Latgé G,2018)。 a. Sense lncRNA:这类lncRNA与相邻基因...
大量实验证实，lncRNA与人类疾病的发生发展密不可分，可在表观遗传、顺式或反式转录及转录后水平上调控基因表达，参与X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等生物学进程，但经实验鉴定的与疾病相关的lncRNA数量仅为已鉴定基因座的1％不到，其生物学功能有待进一步挖掘(Quek et al....
LncRNA在基因表达的时空调控中起着关键作用,可以调控mRNA的表达。为深入了解肿瘤中各类细胞里lncRNA对基因表达的调控机制,我们在上述泛癌种样本中对lncRNA-mRNA 的相关关系进行分析,找到近6万对在不同癌种中特异性表达的lncRNA-mRNA关系对,以及1万多对细胞类型特异性的lncRNA-mRNA关系对(图10)。 图10. 在不同...
近几年来随着研究的深入展开,越来越多的证据表明lncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达,参与基因组印记、染色质修饰、转录激活等多种重要的调控过程,在发育和基因表达中发挥了复杂精确的调控作用,并参与肿瘤的增殖、凋亡及侵袭转移等多个生物学过程。 图1 LncRNA及其在癌症中的作用 图片来源:Nat Rev...
【1.1】lncRNA的功能 lncRNA可通过与DNA/RNA结合或与蛋白结合而行使其功能。一些lncRNA实际上是某些调控RNA(如microRNA或piwi RNA)的前体。与miRNA不同的是,lncRNA没有一种普遍的作用模式,它以许多不同的方式来调控基因表达和蛋白合成。研究发现,一些lncRNA参与了基因调控的基本过程,包括染色质修饰和结构以及直接...
为了方便大家的理解,咱们来看看lncRNA的特点。简单讲,lncRNA的本质是RNA,是由核苷酸组成的长链,有以下几个优势:(1) 可以轻松的与同源DNA序列(转录lncRNA的基因以及序列相似的基因)结合;(2) 可以轻松的与同源RNA序列结合;(3) 其丝带般的特点可以折叠成复杂的二级结构,轻松与多种蛋白质结合。也就是说,lncRNA...
图2: lncRG1和lncRG2含有反向重复序列,能够通过产生大量小RNA对同源基因进行转录后调控 图3: Graphical summary 普渡大学马渐新教授与中国科学院东北地理与农业生态研究所冯献忠研究员为论文的共同通讯作者。普渡大学博士生/博后王伟东(现中国农业大学农学院教授),博后段静波,博后王旭彤(现华中农业大学植物科学技术学院教...
通过与mRNA共享共同的miRNA结合位点或引导miRNA降解,lncRNA通过与miRNA相互作用与miRNA靶基因(TF或非TF基因)竞争。尽管lncRNA在癌症中发挥重要作用,但它如何在复杂而动态的细胞系统中发挥调控作用仍是很大程度上的未知,特别是在泛癌症水平上。在这篇文章中,开发了一种分析策略来探索lncRNA、miRNA、TFs和基因之间的协同...
1、Intronic lncRNA,内含子lncRNA:主要产生于编码基因的内含子区域; 2、Intergenic lncRNA,基因间区的lncRNA,也称作lincRNA:主要产生于两个编码基因的中间区域; 3、Antisense lncRNA,反义lncRNA:主要产生于编码基因的反义链; 具体如下图所示: 按基因组上lncRNA的产生位置来分类(Scheuermannet al.The EMBO Journa...
此前被认为与多种癌症发生相关的Malat1分子是一种长链非编码RNA(lncRNA),其在基因调节过程中扮演着多种角色。在此前对小鼠的研究中,研究人员进行了遗传学筛查发现了可能会促使休眠中的转移性乳腺癌细胞重新激活的因子,其中最引人瞩目的...